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Les paramètres de l'onglet Alignement contrôle l'algorithme pour aligner les lignes dans la comparaison. Sélectionner Alignement trié pour réordonner les lignes en se basant sur leurs clés avant de les aligner. Sélectionnez Non aligné pour comparer des fichiers sans aligner les lignes en se basant sur leur contenu. Sélectionnez Alignement standard pour alignes les fichiers en comparant des sections successivement de plus en plus petites de chaque fichier. Des parties de l'alignement peut être montrées avant que la comparaison complète soit finie. Sélectionnez Alignement Myers O(ND) pour aligner les fichiers en utilisant un algorithme standard LCS (Longest Common Subsequence / Sous-séquence Commune la plus Longue). Cela peut donner de meilleures correspondances dans certains cas tels que de grandes insertions ou lorsque les fichiers contiennent beaucoup de textes répétitifs. Comme les fichiers sont comparés comme un tout, de grands fichiers prennent beaucoup plus de temps que la méthode standard, et les fichiers ne sont pas affichés tant que la comparaison n'est pas terminée. Cela ne supporte pas des comparaisons de similarité, c'est pourquoi les non-correspondances seront groupées en blocs. Sélectionnez Alignement Patience Diff pour aligner les fichiers en utilisant l'algorithme de Bram Cohen. Cochez la case Utiliser la correspondance de proximité pour essayer d'aligner le reste des lignes qui ne correspondent pas en se basant sur leur similarité.